Al poco tiempo de su nacimiento el organismo comenzó a dar sus primeros pasos con el descubrimiento del primer yacimiento de uranio en El Papagayo, Mendoza, mientras que en 1952 se materializa la compra del sincrociclotrón instalado en la sede central de la CNEA.

Consciente de la importancia estratégica del sector, Perón ubica en 1954 a través del decreto?12.205 a la CNEA bajo?la dependencia de la Presidencia de la Nación, área en la que se mantendrá durante décadas.

Otro de los grandes pasos deviene en 1955 al resolverse, junto con la Universidad Nacional de Cuyo, inaugurar en San Carlos de Bariloche el primer Instituto de Física (hoy Balseiro), que fuera simiente de la rigurosa formación de casi 600 profesionales.

En 1957 la CNEA pasa a incorporarse como miembro activo del Organismo Internacional de Energía Atómica, con sede en Viena.

Tras seis décadas de actividad en todo el país funcionan 335 centros asistenciales especializados en aplicaciones en favor de la medicina humana, centros que tuvieron su primer antecedente en la inauguración del Laboratorio de Radioisótopos para Estudios Hematológicos que pasó a funcionar en el Hospital de Clínicas.

Con una docena de reactores de investigación construidos en el país y el exterior, la actividad nuclear contabiliza la existencia de tres centrales de potencia, una de ellas (Atucha II) a pocos meses de ver finalizar su construcción.

En 1994 la CNEA asistió a la separación del manejo de las usinas de Atucha I y II y Embalse, acto que dio origen al nacimiento de Nucleoeléctrica Argentina, bajo cuya dirección en el 2006 el gobierno del ex Presidente Néstor Kirchner confió la conclusión de Atucha II en el contexto del relanzamiento de todo el plan nuclear.

Actualmente la CNEA cuenta con cinco institutos de investigación y formación, cuatro aceleradores de partículas –entre los que sobresale el Tandar–?dos plantas de irradiación, una planta de producción de agua pesada, una planta de purificación de uranio y un centro dedicado a desarrollos en reactores de potencia.

A pocos días de suscribirse con Rosaton (el organismo estatal de energía atómica de la Federación de Rusia) de una serie de acuerdos que permitirán al sector dar un paso?de una magnitud más relevante que el convenio firmado en 1968 con Siemens, que dio paso a la construcción de Atucha I, el acto por realizarse en Ezeiza contaría con la asistencia de la jefa de Estado, Cristina Fernández, y el ministro de Planificación,?Julio Miguel De Vido.